当分解速度缓慢下降，释放的热量逐渐减少时，堆温也逐渐下降。将污泥发酵成有机肥，如再加入部分牛粪等，就会发酵成有机肥，具体操作方法如下：1、加菌1公斤肥料发酵剂可发酵4吨左右污泥+牛粪!需按重量比加30-50%左右的牛粪，或秸秆粉、蘑菇渣、花生壳粉、或稻壳、锯末等有机物料以便调节通气性!其中如果加入的是稻壳、锯末，因其纤维素木质素较高，应延长发酵时间。2、建堆备料后边撒菌边建堆，堆高与体积不能太矮太小！
1公斤沃宝发酵剂!使用菌种时，用30-50倍的辅料如麸皮、玉米面等与菌种混合均匀，备生产使用!三、原料混合：将畜禽粪便、辅料按照3：1进行配比，配方组成（按质量比计）为畜禽粪便70-85%，辅料15-30%.在原料和辅料混合的同时均匀掺入菌种，辅料主要功能是调节水分及物料的透气性.适宜水分含量在50-60%，判断方法：用手抓紧物料未见有水渗滴，松手物料能散开即可。此状态既可保持物料的通气又可满足微生物活动需要!
发酵周期时间为10-15天，冬天气温较低时，应适当延长发酵时间.五、堆放（后熟）：上述原料发酵过程完成之后，从发酵槽或发酵堆中移出，推送到后熟车间堆放，此阶段堆高、堆宽、堆长均无限制，可本着充分利用场地的需要，适当增加物料堆高。期间每隔7-10天进行移堆，移堆2-3次后完成堆放，完成腐熟！腐熟完全的判定标准为：发酵后的有机肥无蛆虫、无生粪便，为黄褐色或灰褐色，无恶臭味、有较淡氨气味，用手可搓碎部分辅料。
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污泥的高温好氧发酵过程实际上就是污泥中微生物发酵过程.不溶性大分子有机物则先附着在微生物体外，由微生物所分泌的胞外酶分解为可溶性小分子物质，再送入微生物细胞内被利用.堆体中基质的形态很复杂，只有分解为简单形态才能为微生物利用!例如蛋白质的分解过程是：蛋白质-胨-肽-氨基酸-氨化物-细菌原生质及氮气或氨气.碳水化合物的分解过程是：碳水化合物-单糖-有机酸-二氧化碳与细菌原生质!通过微生物的生命活动—合成及分解过程，把一部分被吸收的有机物氧化成简单的无机物，并提供生命活动所需要的能量，把另一部分有机物转化合成新的细胞物质，使微生物增殖！
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污泥的透气性比较差，自然堆腐发酵周期太长而且伴有恶臭味.主要是要判定使用的有机肥是否发酵腐熟完全，不经发酵剂发酵，未腐熟的有机肥直接施入农田有以下危害：（1）引起烧根烧苗。不发酵的畜禽粪便施到农田，因为发酵不完全，会发生“二次发酵”的现象，发酵产生的热量会影响作物生长，引起“烧根、烧苗”，严重时会导致植株死亡!（2）病虫害的威胁。粪便中含有大肠菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播、作物发病，对食用农产品的人的身体健康也会产生影响；未腐熟有机物质在土壤中发酵时，容易滋生病菌与虫害，导致植物病虫害的发生.
3、拌匀通气肥料发酵剂是需要耗氧发酵，故应加大供氧措施，做到拌匀、勤翻、通气为宜.否则会导致厌氧发酵而产生臭味，影响效果。4、水分发酵物料的水分应控制在60～65%!水分判断：手紧抓一把物料，指缝见水印但不滴水，落地即散为宜.水少发酵慢，水多通气差，还会导致产生臭味.5、温度启动温度应在15℃以上较好，发酵升温控制在70-75℃以下为宜。6、完成第2-3天温度达65℃以上时应翻倒，一般一周内可发酵完成，物料呈黑褐色，温度开始降至常温，表明发酵完成。
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