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鸡粪还可经发酵制成高档*有机肥料或进一步制成有机无机生物配方肥（简称生物肥），带来很好的经济效益、生态效益和社会效益。比如，以每只鸡年产鲜粪41.4千克，万只鸡场年产鲜粪414吨算，可发酵饲料达200吨，如全部自用，可节省约16万元饲料成本，如出售，可产生24万元的经济收入。但如果不经发酵处理，直接将鲜粪出售只能得到6万元左右的收入，两相比较，发酵的经济回报是明显的。据不完全统计，我国现在年产鲜鸡粪约6000万吨(不包括散养户鸡粪)，折合干鸡粪1800多万吨，如全部作为饲料，可节省麦粉等精料300多万吨，折合人民币约30多亿元。
好旺农em菌发酵鸡粪作肥料
若用好旺农em菌液发酵鸡粪，须20天腐熟，能无臭、无味、无害，堆肥松软呈黄褐色，堆内有灰白色菌丝，有机质45%左右。操作：将干鸡粪呈长条状平铺在地上，按鸡粪重的35%浇水，每吨鸡粪撒好旺农em菌液4公斤，应先加入米糠或麦麸稀释，加过磷酸钙15公斤除臭，加草粉或草炭100~150公斤。而后将堆肥翻倒两三遍，堆成高约1米、宽2米的长方形物料堆，并在堆顶打孔通气。*后用长方形塑料布将肥堆覆盖，塑料布与地面相接触，隔1米压一重物，使膜内既通风又避免被大风吹起。
夏、秋季节早晚要揭膜通风一次（1~2小时），天气晴朗时可在头一天傍晚揭膜，次日早上覆盖。堆沤4~6天后，堆温可升至50~65℃。如为鲜鸡粪，则先应在地上铺一层秸秆粉，也可用米糠、草粉、花生壳粉、草炭替代，然后将湿鸡粪铺在上面，按堆料重量撒入0.1%的尿素，按每吨重量撒入20公斤左右的过磷酸钙，将4公斤好旺农em菌液与麸皮或米糠混合撒入。发酵过程中将堆肥翻倒两遍，堆成宽1.5~2米、高1米左右、长度不限的堆，并用棍在堆内打通气孔，盖上塑料布保温、保湿、保肥。应特别注意通风换气。堆沤10天后可翻堆一次，堆沤20天即能熟透。