钼酸铵广泛用作生产高纯度钼制品的基本原料。比如，热解离钼酸铵生产高纯三氧化钼、用硫化氢硫化钼酸铵溶液生产高纯二硫化钼，通过钼酸铵生产各种含钼的化学试剂等。钼酸铵也常用作生产钼催化剂、钼颜料等钼的化工产品的基本原料。钼酸铵为白色或淡绿色晶体，相对密度为2.498。溶于水、酸和碱中，不溶于醇。加热至90℃时失去1个结晶水，190℃时分解成氨、水和三氧化钼。放置空气中风化，失去一部分氨。工业上一般用辉钼矿（MoS2）焙烧脱硫，用氨水浸出而制得。钼酸铵主要用于冶炼钼铁和制取三氧化钼、金属钼粉作为钨钼合金、钼丝的原料;其次是用于作化工的催化剂;少量用作农用钼肥;极少量用于医药方面,为多种酶的组成部分，钼的缺乏会导致龋齿、肾结石、克山病、大骨节病、食道癌等疾病。主要用于长期依赖静脉高营养的患者。
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