三疣梭子蟹的体色随周围环境而变异。生活于砂底的个体，头胸甲呈梭形，稍隆起，表面具分散的颗粒，在鳃区的较粗而集中，此外又有横行的颗粒隆浅3条，胃区、腮区各一条。疣状突起共3个，胃区一个，心区两个。额分两锐齿，较眼窝背缘的内齿略小，眼窝背绿的外齿相当大，眼窝腹缘的内齿长大而尖锐，向前突出。口上脊露出在两个额齿之间。前侧缘包括外眼窝齿共具9齿，末齿长大，呈刺状。螯足发达，长节呈棱柱形，前缘具4锐刺，腕节的内、外缘末端各具一刺，后侧面具3条颗粒隆线，掌节在雄性甚长，背面两隆脊的前端各具一刺，外基角具一刺。可动指背面具2隆线，不动指外面中部有一沟。两指内缘均具钝齿。第四对步足呈桨状，长、腕节均宽而短，前节与指节扁平，各节边缘具短毛。雄陆蓝绿色，雌性深紫色。头胸甲长82毫米，宽149毫米
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